Er wordt door de groep de focus gelegd op een beperkt aantal onderwerpen:
Doel van de onderzoekslijn Diabetes is onderzoek op het gebied van pathofysiologie van type 2 diabetes en diabetesgerelateerde aandoeningen, preventie van diabetes en diabetesgerelateerde aandoeningen en organisatie van de diabeteszorg in de eerste lijn.
Daarvoor maken wij gebruik van epidemiologische en experimentele onderzoeksmethoden in populatiecohorten en patiëntengroepen.  De belangrijkste onderzoekscohorten zijn:

Hoorn-studie
Het epidemiologisch onderzoek naar het voorkomen van glucosetolerantie stoornissen, is gestart in 1989 met de Hoorn-studie. Later zijn ook risicofactoren voor het ontstaan van diabetes en diabetes gerelateerde complicaties aan het onderzoek toegevoegd in een prospectieve follow-up van het Hoorn-studie cohort. Oorspronkelijk waren 3553 mannen en vrouwen van 50-76 jaar uitgenodigd, en deden er uiteindelijk 2484 (71%) mee. Na dit eerste onderzoek zijn de deelnemers gevolgd met betrekking tot het optreden van ziekten en oorzaakspecifieke sterfte. De laatste (baseline)metingen zijn eind 2007 voltooid. In deze twee cohorten worden vooral vraagstellingen over pathofysiologie van type 2 diabetes en diabetesgerelateerde aandoeningen onderzocht.

Diabetes Zorgsysteem West-Friesland
In 1996 is de diabeteszorg in de regio West-Friesland gestructureerd opgezet, samen met de huisartsen, de thuiszorg organisatie, het regionale ziekenhuis en de belangrijkste zorgverzekeraar in de regio. Het Diabetes Zorgsysteem West-Friesland (DZS) ontwikkelde zich tot een diabetes management systeem en is een onafhankelijke stichting geworden, bestuurd door regionale huisartsen. Er zijn momenteel 6000 type 2 diabetespatiënten in het systeem opgenomen waarvan jaarlijks uitgebreide metingen worden verricht. In dit diabetespatiënten cohort wordt verschillend onderzoek gedaan naar effecten van de zorg, de positie van de huisarts in de diabeteszorg en naar methoden om de rol van de diabetespatiënt te versterken. De DZS populatie is tevens onderdeel van het Parelsnoer project, een universiteit overstijgend onderzoek waarbij naast de gebruikelijke parameters ook biobank materiaal wordt verzameld. Ook wordt de (kosten)effectiviteit van het diabetes management model geanalyseerd in een gerandomiseerd onderzoek. In dit onderzoek wordt in samenwerking met het Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu  (RIVM) de kosteneffexctiviteit onderzocht. In samenwerking met RIVM en het Institute for Medical Technology Assessment  (iMTA) van de Erasmus Universiteit Rotterdam wordt een model geconstrueerd (het zogenaamde MICADO model) dat de effecten op de langere termijn van de veranderingen van zowel glycaemische instelling als ook de veranderingen van cardiovasculaire risicofactoren in beeld brengen.

Overige cohorten
In 2007 is het leefstijlonderzoek West-Friesland gestart. Dit onderzoek wordt uigevoerd bij 600 personen in de leeftijd 30-50 jaar. Deze personen zijn geselecteerd op basis van een grote middelomvang uit 12.000 bij huisartsen ingeschreven personen in West-Friesland. In dit onderzoek wordt een op basis van cognitieve gedragsbehandeling een leefstijlinterventie toegepast in een gerandomiseerde klinische trial. In dit cohort wordt met name gekeken naar preventie van diabetes en diabetesgerelateerde aandoeningen.
Binnen zorgmodellen wordt bovendien onderzoek verricht naar elementen van zelf-management door de patiënt en naar cognitieve gedragsinterventie. Met behulp van een Europese subsidie van de EFSD  worden in een gerandomiseerde trial de effecten van zelfcontrole van bloed- en urineglucose onderzocht. In samenwerking met de afdeling Oogheelkunde wordt met behulp van gegevens uit het Westfries Zorgsysteem  een netvliesscreening model geconstrueerd dat beoogt de netvliesschade bij diabetespatiënten te voorspellen.
De overige onderzoeken zijn vooral gericht op patiëntenparticipatie en patiëntenbeleving. Er wordt in dat kader onderzoek gedaan naar het instellen op insuline met ondersteuning van een internetprogramma door patiënten zelf. Er wordt onderzoek gedaan naar een optimale wijze van risico communicatie en naar medicatiepatronen bij mensen met type 2 diabetes. Ook wordt gekeken naar de mate van seksueel disfunctioneren bij mensen met diabetes.