Behalve het geven van topzorg aan mensen met MS wordt er in het centrum ook onderzoek gedaan naar het verbeteren van de diagnose en de behandelingswijze.
MRI speelt tegenwoordig een belangrijke rol bij de diagnose van MS. In de afgelopen jaren heeft wetenschappelijk onderzoek geleid tot nieuwe richtlijnen voor de diagnose van MS, waarin MRI zeer belangrijk is. In het MS Centrum Amsterdam zijn de diagnostische MRI-criteria ontwikkeld die wereldwijd gebruikt worden. Lopend onderzoek zal deze criteria steeds verbeteren. Ook wordt er onderzocht hoe MRI gebruikt kan worden voor het voorspellen van de beloop van MS.
In het centrum kunnen mensen met MS terecht bij verschillende specialisten. De verschillende specialisaties doen individueel, maar ook gezamenlijk onderzoek naar het verbeteren van de zorg aan mensen met MS.